La actividad investigadora del Servicio de Cirugía se fundamenta en el desarrollo de la línea de investigación del "Fracaso Multiorgánico", sus bases fisiopatológicas, sus implicaciones genéticas y su modulación farmacológica, tanto a nivel experimental como en ensayos clínicos. La financiación de los distintos Proyectos de Investigación ha sido realizada tanto por la Junta de Andalucía como por el Fondo para las Investigaciones Sanitarias. El desarrollo de dichos proyectos se ha llevado a cabo en las instalaciones de la Unidad Experimental. En dicha Unidad también se han desarrollado programas para el perfecionamiento de técnicas quirúrgicas en animales de experimentación, fundamentalmente destinadas al aprendizaje de procedimientos quirúrgicos realizados por abordaje laparoscópico y al entrenamiento en la técnica quirúrgica de la extracción e implante hepático. Actualmente se están realizando investigaciones con técnicas de microarrays para profundizar en el conocimiento de la fisiopatología del síndrome de disfunción multiorgánica.